| 於:阪神甲子園球場 | ||
| <1回戦> | ||
| 星 稜 | 9−4 | 藤 蔭 |
| 石川 | 大分 | |
| 済 美 | 5−4 | 中央学院 |
| 愛媛 | 西千葉 | |
| 慶應義塾 | 3−2 | 中 越 |
| 北神奈川 | 新潟 | |
| 高 知 商 | 14−12 | 山梨学院 |
| 高知 | 山梨 | |
| 大阪桐蔭 | 3−1 | 作新学院 |
| 北大阪 | 栃木 | |
| 沖 学 園 | 4−2 | 北 照 |
| 南福岡 | 南北海道 | |
| 佐久長聖 | 5−4 延14TB |
旭川大高 |
| 長野 | 北北海道 | |
| 高 岡 商 | 4−1 | 佐 賀 商 |
| 富山 | 佐賀 | |
| 近 江 | 7−3 | 智辯和歌山 |
| 滋賀 | 和歌山 | |
| 前橋育英 | 2−0 | 近 大 付 |
| 群馬 | 南大阪 | |
| 常葉大菊川 | 8−7 | 益 田 東 |
| 静岡 | 島根 | |
| 日南学園 | 2−0 | 丸亀城西 |
| 宮崎 | 香川 | |
| 金 足 農 | 5−1 | 鹿児島実 |
| 秋田 | 鹿児島 | |
| 大垣日大高 | 9−3 | 東海大熊本 |
| 岐阜 | 熊本 | |
| 花咲徳栄 | 8−5 | 鳴 門 |
| 北埼玉 | 徳島 | |
| 横 浜 | 7−0 | 愛産大三河 |
| 南神奈川 | 東愛知 | |
| 下関国際 | 4−2 延10回 |
花 巻 東 |
| 山口 | 岩手 | |
| 創志学園 | 7−0 | 創 成 館 |
| 岡山 | 長崎 | |
| 興 南 | 6−2 | 土浦日大高 |
| 沖縄 | 茨城 | |
| 木更津総合 | 10−1 | 敦賀気比 |
| 東千葉 | 福井 | |
| 日 大 三 | 16−3 | 折尾愛真 |
| 西東京 | 北福岡 | |
| 奈良大付 | 4−1 | 羽 黒 |
| 奈良 | 山形 | |
| 龍谷大平安 | 3−2 | 鳥取城北 |
| 京都 | 鳥取 | |
| 八戸学光星 | 9−8 延10回 |
明 石 商 |
| 青森 | 西兵庫 | |
| <2回戦> | ||
| 報徳学園 | 3−2 | 聖光学院 |
| 東兵庫 | 福島 | |
| 愛工大名電 | 10−0 | 白 山 |
| 西愛知 | 三重 | |
| 二松大付 | 5−2 | 広 陵 |
| 東東京 | 広島 | |
| 浦和学院 | 9−0 | 仙台育英 |
| 南埼玉 | 宮城 | |
| 済 美 | 13−11 延13TB |
星 稜 |
| 愛媛 | 石川 | |
| 高 知 商 | 12−6 | 慶應義塾 |
| 高知 | 北神奈川 | |
| 大阪桐蔭 | 10−4 | 沖 学 園 |
| 北大阪 | 南福岡 | |
| 高 岡 商 | 5−4 | 佐久長聖 |
| 富山 | 長野 | |
| 近 江 | 4−3 | 前橋育英 |
| 滋賀 | 群馬 | |
| 常葉大菊川 | 3−0 | 日南学園 |
| 静岡 | 宮崎 | |
| 金足農 | 6−3 | 大垣日大高 |
| 秋田 | 岐阜 | |
| 横 浜 | 8−6 | 花咲徳栄 |
| 南神奈川 | 北埼玉 | |
| 下関国際 | 5−4 | 創志学園 |
| 山口 | 岡山 | |
| 木更津総合 | 7−0 | 興 南 |
| 東千葉 | 沖縄 | |
| 日 大 三 | 8−4 | 奈良大付 |
| 西東京 | 奈良 | |
| 龍谷大平安 | 14−1 | 八戸学光星 |
| 京都 | 青森 | |
| <3回戦> | ||
| 報徳学園 | 愛工大名電 | |
| 東兵庫 | 西愛知 | |
| 浦和学院 | 6−0 | 二松大付 |
| 南埼玉 | 東東京 | |
| 済 美 | 3−1 | 高 知 商 |
| 愛媛 | 高知 | |
| 大阪桐蔭 | 3−1 | 高 岡 商 |
| 北大阪 | 富山 | |
| 近 江 | 9−4 | 常葉大菊川 |
| 滋賀 | 静岡 | |
| 金 足 農 | 5−4 | 横 浜 |
| 秋田 | 南神奈川 | |
| 下関国際 | 4−1 | 木更津総合 |
| 山口 | 東千葉 | |
| 日 大 三 | 4−3 | 龍谷大平安 |
| 西東京 | 京都 | |
| <準々決> | ||
| 大阪桐蔭 | 11−2 | 浦和学院 |
| 北大阪 | 南埼玉 | |
| 済 美 | 3−2 | 報徳学園 |
| 愛媛 | 東兵庫 | |
| 日 大 三 | 3−2 | 下関国際 |
| 西東京 | 山口 | |
| 金 足 農 | 3−2 | 近 江 |
| 秋田 | 滋賀 | |
| <準決勝> | ||
| 金 足 農 | 2−1 | 日 大 三 |
| 秋田 | 西東京 | |
| 大阪桐蔭 | 5−2 | 済 美 |
| 北大阪 | 愛媛 | |
| <決 勝> | ||
| 大阪桐蔭 | 13−2 | 金 足 農 |
| 北大阪 | 秋田 | |
| 大阪桐蔭高校は4年ぶり5度目の優勝 | ||
| 21世紀以降の決勝戦スコア | |
| 2017年度 | 花咲徳栄 14−4 広 陵 |
| 2016年度 | 作新学院 7−1 北 海 |
| 2015年度 | 東海相模 10−6 仙台育英 |
| 2014年度 | 大阪桐蔭 4−3 三 重 |
| 2013年度 | 前橋育英 4−3 延岡学園 |
| 2012年度 | 大阪桐蔭 3−0 光星学院 |
| 2011年度 | 日 大 三 11−0 光星学院 |
| 2010年度 | 興 南 13−1 東海相模 |
| 2009年度 | 中京中京 10−9 日本文理 |
| 2008年度 | 大阪桐蔭 17−0 常葉菊川 |
| 2007年度 | 佐 賀 北 5−4 広 陵 |
| 2006年度 | 早稲田実 4−3 駒大苫小 |
| 2005年度 | 駒大苫小 5−3 京外大西 |
| 2004年度 | 駒大苫小 13−10 済 美 |
| 2003年度 | 常総学院 4−2 東 北 |
| 2002年度 | 明徳義塾 7−2 和・智辯 |
| 2001年度 | 日 大 三 5−2 近 江 |
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