| 於:阪神甲子園球場 | ||
| <1回戦> | ||
| 聖光学院 | 5−3 | 東 筑 |
| 福島 | 福岡 | |
| 國學院栃木 | 3−2 | 英 明 |
| 栃木 | 香川 | |
| 明秀日立 | 4−3 | 瀬 戸 内 |
| 茨城 | 広島 | |
| 日 大 三 | 5−0 | 由 利 工 |
| 東京 | 秋田 | |
| <2回戦> | ||
| 静 岡 | 7−0 | 駒大苫小牧 |
| 静岡 | 北海道 | |
| 日航空石川 | 10−0 | 膳 所 |
| 石川 | 滋賀 | |
| 明徳義塾 | 7−5 | 中央学院 |
| 高知 | 千葉 | |
| 智辯和歌山 | 4−2 | 富 山 商 |
| 和歌山 | 富山 | |
| 智辯学園 | 5−3 | 日大山形 |
| 奈良 | 山形 | |
| 創 成 館 | 3−1 | 下関国際 |
| 長崎 | 山口 | |
| 大阪桐蔭 | 14−2 | 伊 万 里 |
| 大阪 | 佐賀 | |
| 花 巻 東 | 5−3 | 東 邦 |
| 岩手 | 愛知 | |
| 東海大相模 | 12−3 | 聖光学院 |
| 神奈川 | 福島 | |
| 國學院栃木 | 9−5 | 延岡学園 |
| 栃木 | 宮崎 | |
| 明秀日立 | 10−1 | 高 知 |
| 茨城 | 高知 | |
| 彦 根 東 | 4−3 | 慶應義塾 |
| 滋賀 | 神奈川 | |
| 乙 訓 | 7−2 | おかや山陽 |
| 京都 | 岡山 | |
| 近 江 | 8−5 | 松山聖陵 |
| 滋賀 | 愛媛 | |
| 星 稜 | 11−2 | 富 島 |
| 石川 | 宮崎 | |
| 三 重 | 8−0 | 日 大 三 |
| 三重 | 東京 | |
| <3回戦> | ||
| 東海大相模 | 8−1 | 静 岡 |
| 神奈川 | 静岡 | |
| 日航空石川 | 3−1 | 明徳義塾 |
| 石川 | 高知 | |
| 智辯和歌山 | 7−4 | 國學院栃木 |
| 和歌山 | 栃木 | |
| 創 成 館 | 2−1 延10回 |
智辯学園 |
| 長崎 | 奈良 | |
| 大阪桐蔭 | 5−1 | 明秀日立 |
| 大阪 | 茨城 | |
| 花 巻 東 | 1−0 延10回 |
彦 根 東 |
| 岩手 | 滋賀 | |
| 三 重 | 2−1 | 乙 訓 |
| 三重 | 京都 | |
| 星 稜 | 4−3 延10回 |
近 江 |
| 石川 | 滋賀 | |
| <準々決> | ||
| 東海大相模 | 3−1 | 日航空石川 |
| 神奈川 | 石川 | |
| 智辯和歌山 | 11−10 延10回 |
創 成 館 |
| 和歌山 | 長崎 | |
| 大阪桐蔭 | 19−0 | 花 巻 東 |
| 大阪 | 岩手 | |
| 三 重 | 14−9 | 星 稜 |
| 三重 | 石川 | |
| <準決勝> | ||
| 智辯和歌山 | 12−10 延10回 |
東海大相模 |
| 和歌山 | 神奈川 | |
| 大阪桐蔭 | 3−2 延12回 |
三 重 |
| 大阪 | 三重 | |
| <決 勝> | ||
| 大阪桐蔭 | 5−2 | 智辯和歌山 |
| 大阪 | 和歌山 | |
| 大阪桐蔭高校は2年連続3度目の優勝 | ||
| 21世紀以降の決勝戦スコア | |
| 2017年度 | 大阪桐蔭 8−3 履 正 社 |
| 2016年度 | 智辯学園 2−1 高 松 商 |
| 2015年度 | 敦賀気比 3−1 東海大四 |
| 2014年度 | 龍谷平安 6−2 履 正 社 |
| 2013年度 | 浦和学院 17−1 済 美 |
| 2012年度 | 大阪桐蔭 7−3 光星学院 |
| 2011年度 | 東海相模 6−1 九国大付 |
| 2010年度 | 興 南 10−5 日 大 三 |
| 2009年度 | 清 峰 1−0 花 巻 東 |
| 2008年度 | 沖縄尚学 9−0 聖望学園 |
| 2007年度 | 常葉菊川 6−5 大垣日大 |
| 2006年度 | 横 浜 21−0 清 峰 |
| 2005年度 | 愛工名電 9−2 神村学園 |
| 2004年度 | 済 美 6−5 愛工名電 |
| 2003年度 | 広 陵 15−3 横 浜 |
| 2002年度 | 報徳学園 8−2 鳴 門 工 |
| 2001年度 | 常総学院 7−6 仙台育英 |